DE OLIVEIRA ANDRADE LJ1; MATOS DE OLIVEIRA LC2, MATOS DE OLIVEIRA GC3, VINHAES BITTENCOURT AM4, PEIXOTO SILVA C5, MATOS DE OLIVEIRA L5
El objetivo del trabajo fue evaluar la imitación molecular entre la proteína ZnT8 y las proteínas del virus COVID-19, así como su impacto potencial en el inicio de la T1DM. Para este estudio, se obtuvieron las secuencias de aminoácidos de las proteínas ZnT8 y COVID-19 de las bases de datos de UniProt. Los datos de la estructura de las proteínas ZnT8 y COVID-19 se obtuvieron de Swiss-Model. Se realizó un alineamiento de múltiples secuencias utilizando Vector Builder para analizar las similitudes y regiones conservadas entre las proteínas. Se utilizó el Alineamiento Estructural por Pares para evaluar el alineamiento tridimensional de las proteínas ZnT8 y COVID-19. Los resultados de similitud entre las proteínas ZnT8 y COVID-19 son los siguientes: 1. ZnT8_HUMAN y SPIKE_SARS2: similitud del 16.67%; 2. ZnT8_HUMAN y VME1_SARS2: similitud del 26.37%; 3. Proteína ZnT8 y proteína VEMP_SARS2 de la envoltura pequeña de la membrana: similitud del 11.26%; y 4. Proteína ZnT8 y A0A883GPN5_SARS2 Nucleoproteína: similitud del 32.94%. Basándonos en los resultados obtenidos, se puede concluir que existe un nivel importante de imitación molecular entre la proteína ZnT8 y ciertas proteínas del virus COVID-19. Estos hallazgos brindan información sobre el impacto potencial de esta imitación molecular en el desencadenante de la T1DM.
The objective was to assess the molecular mimicry between the ZnT8 protein and proteins of the COVID-19 virus, as well as its potential impact on the initiation of T1DM.For this study, amino acid sequences of ZnT8 and COVID-19 proteins were obtained from UniProt databases. Protein structure data for ZnT8 and COVID-19 proteins were acquired from Swiss-Model. Multiple sequence alignment using Vector Builder was performed to analyze similarities and conserved regions between the proteins. Pairwise Structure Alignment was used to assess the three-dimensional alignment of ZnT8 and COVID-19 proteins. The similarity results between ZnT8 and COVID-19 proteins are as follows: 1. ZnT8_HUMAN and SPIKE_SARS2: similarity of 16.67%; 2. ZnT8_HUMAN and VME1_SARS2: similarity of 26.37%;3. ZnT8 protein and VEMP_SARS2 Envelope small membrane protein: similarity of 11.26%; and 4. ZnT8 protein and A0A883GPN5_SARS2 Nucleoprotein: similarity of 32.94%.Based on the results obtained, it can be concluded that there is a level important of molecular mimicry between the ZnT8 protein and certain proteins of the COVID-19 virus. These findings provide insights into the potential impact of this molecular mimicry on the trigger of T1DM.