REVISTA ARGENTINA DE ENDOCRINOLOGÍA Y METABOLISMO
Luís Jesuíno de Oliveira Andrade1; Gabriela Correia Matos de Oliveira2; Alcina Maria Vinhaes Bittencourt3;
Osmário Jorge de Mattos Salles4; Luís Matos de Oliveira1
Este estudio tuvo como objetivo desarrollar y validar un modelo integrado de riesgo de metástasis ganglionar (MG) en carcinoma papilar de tiroides (CPT) mediante la combinación de firmas de microARN del clasificador mir-THYpe® con análisis bioinformáticos derivados de la cohorte TCGA-THCA. Los perfiles de expresión y los datos clínicos de 378 casos de CPT provenientes de TCGA-THCA fueron analizados utilizando DESeq2. Tres microARN del panel mir-THYpe® (hsa-miR-146b-5p, hsa-miR-222-3p y hsa-miR-204-5p) y tres variables clínicas (extensión extratiroidea, tamaño tumoral y multifocalidad) fueron seleccionados mediante regresión LASSO con validación cruzada de diez pliegues. Posteriormente, se realizaron análisis de predicción de genes diana, enriquecimiento funcional e interacción proteína-proteína. El modelo multivariado final y el nomograma fueron evaluados mediante análisis ROC, calibración de Hosmer–Lemeshow y análisis de curvas de decisión, con validación externa en la cohorte GSE60542. El modelo integrado demostró un adecuado desempeño discriminativo, alcanzando valores de AUC de 0,841 en la cohorte de entrenamiento; 0,812 en la cohorte de validación interna y 0,786 en el conjunto de validación externa. Entre los predictores significativos se incluyeron la extensión extratiroidea (OR=3,84), la sobreexpresión de hsa-miR-146b-5p (OR=3,12) y el tamaño tumoral >1,0 cm (OR=2,67). El análisis de curvas de decisión sugirió un beneficio clínico neto favorable en comparación con estrategias basadas exclusivamente en variables clínicas y estrategias de referencia, a lo largo de umbrales de probabilidad clínicamente relevantes. La integración de datos moleculares derivados de mir-THYpe® con características obtenidas mediante bioinformática permitió desarrollar un modelo preliminar para la predicción de MG en CPT. El marco predictivo propuesto podría aportar valor incremental más allá de la evaluación clinicopatológica convencional y contribuir, en esta etapa exploratoria, a la generación de hipótesis para una futura estratificación de riesgo preoperatorio más individualizada en pacientes con CPT, pendiente de validación prospectiva.
This study aimed to develop and validate an integrated risk model for lymph node metastasis (LNM) in papillary thyroid carcinoma (PTC) through the combination of mir-THYpe® microRNA classifier signatures with bioinformatics analyses derived from the TCGATHCA cohort. Expression profiles and clinical data from 378 PTC cases obtained from TCGA-THCA were analyzed using DESeq2. Three microRNAs from the mir-THYpe® panel (hsa-miR-146b-5p, hsa-miR-222-3p, and hsa-miR-204-5p) and three clinical variables (extrathyroidal extension, tumor size, and multifocality) were selected through LASSO regression with tenfold cross-validation. Target gene prediction, functional enrichment, and protein–protein interaction analyses were subsequently performed. The final multivariate model and nomogram were evaluated using ROC curve analysis, Hosmer–Lemeshow calibration, and decision curve analysis (DCA), with external validation conducted in the GSE60542 cohort. The integrated model demonstrated adequate discriminatory performance, achieving AUC values of 0.841 in the training cohort, 0.812 in the internal validation cohort, and 0.786 in the external validation dataset. Significant predictors included extrathyroidal extension (OR=3.84), upregulation of hsa-miR-146b-5p (OR=3.12), and tumor size >1.0 cm (OR=2.67). Decision curve analysis suggested a favorable net clinical benefit compared with clinical-only and reference strategies across clinically relevant probability thresholds. The integration of mir-THYpe®-derived molecular data with bioinformatics-based features resulted in a preliminary predictive model for LNM in PTC that requires platform-specific recalibration and further external validation. The proposed predictive framework may provide incremental value beyond conventional clinicopathological assessment and may contribute, at this exploratory stage, to hypothesis generation for future individualized preoperative risk stratification in patients with PTC, pending prospective validation.